Als het hoofd van de Borgia familie in de 15e eeuw tot paus wordt gekozen, krijgen hij en drie van zijn kinderen niet alleen de macht over de kerk, maar bepalen zij ook mede de (inter)nationale politiek.
Brief uit circa 1411 van de Griekse geleerde Chrysoloras (een van de grondleggers van de Italiaanse Renaissance) aan de Byzantijnse keizer Manuel II Paleologus, waarin hij de cultuur van het Romeinse en Byzantijnse rijk vergelijkt.
Ezio Auditore moet Rome bevrijden van de tirannie van de familie Borgia. Hij moet het opnemen tegen de kwaadaardige Cesare Borgia, die heel Italië wil veroveren. Samenzweringen zijn aan de orde van de dag, zelfs binnen het broederschap.