In 1767 verlaat een echtpaar Schotland in de hoop in Amerika een nieuw leven op te kunnen bouwen; twee eeuwen later probeert een nazate van hen in het reine te komen met haar verleden.
Diep onder de grond treft men een mysterieuze machine aan, die alarmerende doemvoorspellingen begint uit te zenden. Terwijl de magiër Zedd een manier probeert te vinden om het sinistere apparaat uit te schakelen, produceert de machine een omen, een profetie waarvan de gevolgen onmogelijk te voorkomen zijn.
Het Instituut spoort paranormaal begaafde kinderen op, ontvoert ze en buit ze uit. Nog nooit heeft een kind het Instituut levend verlaten maar met de komst van de 12-jarige Luke komt daar wellicht verandering in.
