In 1700 ligt Paus Innocentius XI in Rome op sterven. Kerkelijke en wereldlijke leiders voeren al overleg over de opvolging. Ook Abt Atto Melani, diplomaat en spion van de Zonnekoning, komt met dat doel naar Rome.
Met een gezelschap mensen die vanwege de pest in 1683 zitten opgesloten in een Romeinse herberg, voert een geheim agent van de Franse koning een dodelijk gevecht tegen de ziekte en een mysterieuze moordenaar.
1646. Castraatzanger Atto Melani lijdt schipbreuk en strandt met zijn reisgezelschap op het eiland Gorgona in de Middellandse Zee. Daar vindt hij in een oude toren sporen van de schat waarnaar hij op zoek was: verloren gewaande meesterwerken uit de Oudheid. Dan begint een speurtocht waardoor hij niet alleen een verband vindt tussen de meesterwerken, maar ook een vijf jaar eerder gepleegde, nooit opgeloste moord ontdekt.
Een abt vermoedt in de 18e eeuw een complot van de Ottomanen als keizer Jozef I van het Habsburgse Rijk aan de pokken sterft en probeert samen met zijn trouwe helper de waarheid te achterhalen.
De geadopteerde zoon van Leonardo da Vinci schrijft brieven naar zijn onbekende opdrachtgever over de vorderingen die zijn vader maakt in het onderzoek naar een lastercampagne tegen de paus.
De pleegzoon en assistent van Leonardo da Vinci komt in 1508 in Florence in de problemen als hij wordt verdacht van diefstal van een zeldzame atlas in Rome.
