Een bankier heeft als onderpand een kroon met 39 edelstenen ontvangen. Als er opeens drie edelstenen verdwenen blijken te zijn en zijn zoon daarvan verdacht wordt roept hij de hulp in van Sherlock Holmes.
Dit seizoen dringt Red John door tot in het hart van het California Bureau of Investigation. Sinds de seriemoordenaar Patrick Jane’s familie heeft omgebracht, staat alles in het leven van de CBI-consultant en voormalig tv-paragnost in het teken van de zoektocht naar de man die zijn leven heeft kapotgemaakt. Nadat een moordverdachte in zijn gevangeniscel in brand wordt gestoken en een CBI-agent wordt verward met Red John, realiseert Patrick zich dat zijn vijand dichterbij is dan hij dacht.